分子诊断所应用到的分子生物学技术主要包括，聚合链式反应（PCR），荧光定量PCR（qPCR），DNA测序（DNA Sequencing），荧光原位杂交（FISH），DNA印记技术（DNA Blotting），单核酸多态性（SNP）和基因芯片（Gene Chip）等技术。这些技术的操作都离不开一个重要的物质 – 核酸（DNA和RNA）。而由于日常检测中要处理大量的不同来源的核酸以及核酸本身难以降解的特性，核酸污染是困扰绝大多实验室的一个难题。微量的核酸污染会产生假阳性的检测结果，这样会对病人造成误诊，耽误病情。如任由此情况发展，会形成气溶胶污染而扩散，会导致整个实验室的污染，严重的会关闭实验室，如无备用实验室，会造成更大的损失。

在与核酸污染长期抗争中，人们也总结出了一些预防和清除核酸污染的方法。对于预防，实验人员一定要不断改进并严格遵循实验室操作流程，对实验室不同操作进行区域划分，分装试剂，定期对实验仪器进行灭菌，实验室适当通风，养成实验中进行阴阳对照的好习惯。当污染已经出现，传统的清除方法包括对可疑器用稀酸进行擦拭或浸泡，紫外线照射，对反应液用DNaseⅠ或内切酶进行处理等方法。这些方法对一些微量污染会有一定效果，但对污染效果不是很理想，而且紫外线照射会对人体造成一定的危害。近些年来，一些生物试剂公司专门开发研制出一些检测清除核酸污染的试剂，这些试剂具有对人体无害，操作简单，省时等特点，其中一些试剂只需喷洒在污染去经过一段时间的反应，擦除后便可清除污染。但这些产品还是相对传统方法花费略高。

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